在查明证据的过程中，以下是一些关键步骤和方法，它们应当遵循法律规定的程序，确保证据的有效性和合法性：

询问

对当事人、证人或鉴定人进行询问，以获取他们对案情的了解。

讯问

对违法行为人、犯罪嫌疑人或刑事被告人进行讯问，以获取案件的具体情况。

辨认

要求被害人在若干类似的物品、场所或人中挑选出自己曾经见过或听说过的事物。

勘验

执法人员亲临现场，发现和提取证据。

检查

对与案件有关的人身进行检验，如进行人身检查。

搜查

对与案件有关的场所或人身进行强制性寻查、寻找和提取证据材料。

实验

模拟犯罪现场或过程，以验证当事人或证人的陈述。

鉴定

由专业机构或人员利用专业技术知识和设备对特定问题进行检测，并作出鉴定结论。

在收集证据时，应注意以下要点：

合法性：证据的来源必须合法合规。

关联性：证据必须与案件事实相关联。

客观性：证据必须是真实的，虚假证据不被采纳。

及时性：证据的收集应具有时效性，避免证据丢失或失效。

证据链条：证据环节应清晰、关联紧密，互相印证，避免孤立片面或矛盾。

专业协助：在复杂案件中，可委托专业律师或公证处进行证据收集和保全。

以上步骤和方法是调查取证的基础框架，但具体实施时还需根据案件的具体情况和法律要求灵活调整。