政府在某些情况下不能信息公开的原因主要包括以下几点：

涉及国家秘密：

依法确定为国家秘密的政府信息，其公开可能危及国家安全、外交关系、领土完整等核心利益，因此不予公开。

危及安全稳定：

公开后可能危及公共安全、经济安全、社会稳定的政府信息，同样不予公开。这包括可能影响重大经济金融政策有效实施、信息安全或造成经济金融市场异常波动的信息。

保护第三方权益：

涉及商业秘密、个人隐私等公开会对第三方合法权益造成损害的政府信息，行政机关不得公开。但如第三方同意公开，或公开对公共利益有重大影响，可予以公开。

内部事务信息：

行政机关的内部事务信息、函件、决议等，在一般情况下可以不予公开。但这也并非绝对，特定条件下也可公开。

申请理由不合法：

政府在实践中常常以申请人未提供合法的申请理由或申请内容不明确为由拒绝信息公开申请。

涉及第三方权益：

如果行政机关认为所申请的信息涉及企业商业秘密或个人隐私，则应征求企业或者个人的意见，如果企业或者个人不同意公开，则政府机关不予公开。

其他借口：

政府还可能以其他各种借口拒绝信息公开，例如申请信息涉及民族、宗教、侨胞等事项，公开后可能造成不利影响。

综上所述，政府在信息公开方面有一定的限制和规定，主要是为了保护国家安全、公共安全、经济安全和社会稳定，以及保护企业和个人的合法权益。在实际操作中，政府需要严格按照《中华人民共和国政府信息公开条例》及相关法律法规进行判断和处理。