客车超员的计算方法如下：

按座位数计算

每个座位对应一个乘客，超出一个乘客即视为超载。

超员率计算

超员率 = 超出的人数 ÷ 规定的可坐人数。例如，一辆40座位的客车多坐了2人，超员率为2÷40=5%。

超员百分比计算

超员百分比 = （实际载客数量 - 额定载客数量） ÷ 额定载客数量 × 100%。

处罚标准

超过核定人数20%以上的车辆，将按照新交规进行处罚：

驾驶营运客车超过核定人数20%以上的，一次记12分。

驾驶营运客车超过核定人数未达20%的，或者驾驶其他载客汽车载人超过核定人数20%以上的，一次记6分。

驾驶营运客车、校车以外的载客汽车载人超过核定人数未达20%的，一次记3分。

法律依据

《道路交通安全法》第四十九条规定，机动车载人不得超过核定的人数，客运机动车不得违反规定载货。

《道路交通安全法》第九十条规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。

建议

驾驶员应严格遵守客车载客规定，避免超员行驶，以确保行车安全，避免因超员而受到法律的严厉处罚。