小规模纳税人适用5%的征收率主要基于以下原因和规定：

简易计税方法：

小规模纳税人由于会计核算不健全，不能像大企业那样按常规报送复杂的会计资料，因此实行简易办法征收增值税。简易计税方法中，小规模纳税人可以选择按照5%的征收率计算应纳税额。

特殊项目和政策：

在营改增试点中，部分特殊项目适用5%的征收率。例如，原来建筑业、文化体育业营业税税率为3%，金融业、销售不动产、转让无形资产营业税税率为5%，娱乐业营业税税率为5%~20%。营改增后，小规模纳税人在这些领域继续适用5%的征收率。

政策公告：

2023年1月，财政部和税务总局发布了《关于明确增值税小规模纳税人减免增值税等政策的公告》，规定自2023年1月1日至2027年12月31日，对月销售额10万元以下（含本数）的增值税小规模纳税人，免征增值税。尽管这项政策主要针对免税额度，但它体现了小规模纳税人在特定条件下可以适用5%征收率的政策导向。

不动产销售和租赁：

小规模纳税人在销售或出租不动产时，可以选择按照5%的征收率计算应纳税额。具体包括销售其取得的不动产（不含自建）、出租其取得的不动产（不含个人出租住房）等。

其他特定服务：

小规模纳税人提供劳务派遣服务等，也可以选择差额征收，按照简易计税方法依5%的征收率计算缴纳增值税。

综上所述，小规模纳税人适用5%的征收率主要是基于简易计税方法的规定以及特定政策和项目的需要。这种征收方式简化了税收计算和申报流程，有助于减轻小规模纳税人的税收负担。