管理黑车的部门包括 客运管理处、车管所、公安交管局、交警和运管部门。具体管理职责如下：

客运管理处：

根据相关法规，只有客运管理处才有权利查处黑车。

车管所和公安交管局：

一般情况下，黑车由车管所和公安交管局予以管理。

交警：

交警也可以对黑车进行管理，如果黑车涉及到刑事案件，则归公安刑警管。

运管部门：

运管部门包括交通运输管理处、道路运输管理处、城管等，负责查处未经批准非法从事道路运输经营的活动。

因此，管理黑车的部门是多个，具体职责可能因地区和具体情况而异。在实际操作中，这些部门可能会联合行动，共同打击黑车运营。