商业搬迁的清算通常涉及以下几个方面：

补偿计算

按照被拆迁店面的建筑面积和市场评估价进行赔偿。

补偿应包括替代店面土地的价差损失、经营损失、停业停产损失、店面机器设备等固定资产的损失、解聘员工的安置补偿损失、搬迁损失等。

法律依据

《国有土地上房屋征收与补偿条例》规定了相关的补偿内容，包括被征收房屋价值的补偿、因征收房屋造成的搬迁和临时安置的补偿、因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。

行政复议和诉讼

如果承租人未收到应得的赔偿，可以提出行政复议。

若行政复议结果不满意，承租人可以进一步起诉至法院，要求法院判决赔偿。

其他补偿

商住房拆迁补偿还可能包括房屋权属、区位、用途、建筑面积的赔偿，以及房屋内各项家电移机补偿、非住宅房屋营运损失补偿等。

在进行商业搬迁清算时，应确保所有补偿都符合当地法律法规，并且承租人的合法权益得到充分保护。