土地配套费的计算方法如下：

在土地竞拍出让时

国土部门在测算土地价格时，会将配套费测算进土地出让价格中。因此，土地出让合同价即为土地出让的全部收益。

在土地出让时

土地出让价格可以拆分成多个部分分别收取，包括土地出让金、土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费、拆迁补偿费、市政建设配套费等。这种方式一般是以协议转让的方式进行的，主要适用于安置房、保障房、公共建设等项目，而市场上更多的是通过竞拍方式出让土地。

具体计算方式

对于小区项目：

征收费率为基建投资额的5%。计算公式为：配套费 = 建设项目基建投资额计算基数 × 建筑面积 × 5%。

对于零散项目：

征收费率为基建投资额的10.5%。计算公式为：配套费 = 建设项目基建投资额计算基数 × 建筑面积 × 10.5%。

示例

假设一个小区项目的基建投资额为1000万元，建筑面积为10万平方米，那么：

小区项目的配套费 = 1000万元 × 10万平方米 × 5% = 50万元。

建议

明确项目类型：根据项目类型（小区项目或零散项目）确定相应的征收费率。

精确计算：确保计算基数（基建投资额和建筑面积）的准确性，以得出精确的配套费金额。

咨询相关部门：在实际操作中，建议咨询当地住房和城乡建设局或国土部门，以获取最新的计算依据和费率。