公司变更资料的保留期限如下：

公司名称变更

原名称可保留一年以上。在此期间，新注册公司不得使用与企业原名称相同的字号进行工商登记。

合同

合同自履约完成开始算，保存应不少于2年，基本上是不短于合同纠纷诉讼时效。

公司档案

单位档案视情况确定年限，应该有长期、短期、永久保存期限。有些重要档案是在单位成立后形成，需要保存至单位变更或解散后至少2年左右。

营业执照变更

市场主体变更登记事项，应当自作出变更决议、决定或者法定变更事项发生之日起30日内向登记机关申请变更登记。涉及营业执照记载事项的，登记机关应当及时为市场主体换发营业执照。

建议

长期保存：对于公司名称变更的重要文件，如股东会决议、公司章程修正案等，建议永久保存，以便未来可能的查询和法律纠纷。

短期保存：对于合同等一般文件，建议至少保存2年，以满足合同纠纷诉讼时效的要求。

根据具体情况：对于其他档案，应根据其重要性和用途，确定适当的保存期限。

这些建议有助于企业更好地管理和保存变更相关的资料，以应对可能的法律和税务问题。