协议合同中的赔偿金额应根据具体情况和双方的约定来确定。以下是几种可能的赔偿金额确定方式：

具体金额约定

协议中可能会明确列出各项损失的具体金额，例如：

财产损失：人民币×××元

误工费：人民币×××元

其他损失：人民币×××元

然后，协议会给出总的赔偿金额，例如： 人民币×××元。

实际损失计算

赔偿金额也可以根据实际损失来计算，通常不超过实际损失的30%：

实际损失包括直接损失和履行利益损失。

如果约定的违约金低于实际损失，可以申请法院增加；如果过高，可以申请法院减少。

法定赔偿标准

对于某些特定类型的合同，如劳动合同或加工承揽合同，可能有法定的赔偿标准：

劳动合同解除补偿：根据《劳动合同法》第四十七条，按劳动者在本单位工作的年限支付经济补偿金。

加工承揽合同：逾期交付定作物的一方可能需要支付逾期交付部分的酬金总额的千分之一至百分之三十不等的违约金。

惩罚性违约金

某些情况下，违约金可能具有惩罚性，例如：

违约金可以是合同标的额的20%至30%，具体比例根据合同约定和实际损失情况而定。

建议

在签订协议合同时，应详细列出可能的损失项目及金额，并明确总的赔偿金额。

如果实际损失难以确定，可以考虑采用实际损失的一定比例作为违约金。

违约金应合理，既要有惩罚性，又不能过高，以免被法院调整。

双方应在合同中明确违约金的计算方法和支付期限，以减少后续纠纷。

通过以上方式，可以确保协议合同中的赔偿条款既公平合理，又能有效保护双方的权益。