物流公司亏损的原因是多方面的，以下是一些主要原因：

事故跑路：

运输途中发生大事故，导致车辆、货物和人员全部损失，同时保险不到位，造成巨大的资金压力，最终导致公司跑路。

合作站点欠款：

传统的代收款模式导致合作方拖欠货款和运费，加上本地客户的催缴讨要，使得物流公司难以维持运营。

经营不善：

货源过少导致发车不及时，影响公司信誉，形成恶性循环，最终公司老板可能选择跑路。

市场竞争激烈：

物流行业竞争激烈，价格战频发，导致利润空间被压缩。

成本管控不足：

物流公司缺乏有效的成本管控，包括车辆购置、贷款、折旧、保险、维修保养和空驶时间等成本。

“最后一公里”问题：

物流基础设施跟不上，导致“最后一公里”问题突出，影响用户体验。

供应链不畅通：

物流行业与其他相关行业缺乏紧密联系，发展模式单一陈旧，导致快递不快、物流难流。

内部矛盾：

利益分配不均引发内部矛盾，影响运营效率，甚至导致内部关系破裂。

管理不当：

管理不善导致工作效率低，安全事故频发，增加公司负担。

外部压力：

合同周期短使业务稳定性降低，利润压缩；付款周期长导致资金周转困难，负担加重。

诚信缺失：

部分物流公司存在欺骗客户的行为，导致客户信任缺失，业务量下降。

市场集中度低：

物流行业市场集中度低，缺乏有竞争力的模式，导致市场竞争激烈，服务质量下降。

信息化程度低：

物流行业信息化程度低，导致重复投资和运营成本居高不下。

缺乏人才储备：

物流公司老板往往忽视管理人员的储备，导致公司运营缺乏持续性。

综上所述，物流公司亏损的原因是多方面的，包括管理、市场、成本、诚信等多方面因素。要改善物流公司的经营状况，需要从这些方面入手，加强管理、提高服务质量、优化成本结构、建立稳定的客户关系和人才储备。