毕业生档案在自己手中的有效期是 两年。根据我国相关法律规定，档案在个人手中持有的时间最多不能超过两年，否则就会失效，变成无效档案。在学生毕业后，学校通常会给毕业生两年的择业期，在这两年内毕业生可以自行保管档案，但个人档案自己保管的期限只能是小于两年。如果档案在个人手中存放超过两年，可能会导致档案变成“死档”，给日后的使用带来极大的不便。

因此，建议毕业生在毕业后尽快将档案转递到具有档案管理权限的单位或机构进行保管，以确保档案的有效性和合法性。如果毕业生在择业期内找到工作，应尽快将档案转到工作单位或当地的人才市场。如果毕业生在择业期内未找到工作，可以向学校申请暂缓就业，并将档案保留在学校或转入生源地公共就业人才服务机构。