当借条超过两年时，根据《中华人民共和国民法典》的规定，债权人仍然可以向法院提起诉讼。以下是处理这种情况的一些建议：

诉讼时效：

根据《民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。如果借条上约定了还款期限，需要查看债务偿还期限届满到现在是否超过三年。如果超过了，诉讼时效就过了，除非债务人自愿偿还债务。

无约定还款期限：

如果借条上没有预定还款期限，或者约定的还款期限已过，债权人仍然可以携带借条及相关材料向法院起诉。

协商还款：

在诉讼时效期间内，债权人可以尝试与债务人协商还款事宜。如果债务人提出合理的理由证明暂时经济困难，可以重新协商还款日期。

支付令和强制执行：

如果协商无果，债权人可以向法院申请支付令。如果债务人收到支付令后仍不偿还债务，债权人可以申请法院强制执行。

特殊情况：

如果自权利受到损害之日起超过二十年，法院一般不予保护。但在特殊情况下，法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效。

重新签订借条：

如果可能，债权人可以要求债务人重新签订借条，并注明新的还款日期和利息，以此来证明诉讼时效的中断。

请注意，以上信息基于提供的参考信息，具体操作时应以最新的法律法规和法院的实际判决为准。