上海工厂主要搬迁至 长三角地区，特别是江苏省的苏州、昆山等地。这些地区因其地理位置靠近上海，交通便利，且具有较低的生产成本和优惠的税收政策，成为上海工厂迁移的首选地。

具体来看，昆山市因其优越的地理位置和完善的交通网络，成为接纳上海工厂的主要城市之一。许多电子信息产业的加工厂迁至昆山后迅速发展，形成了长三角地区最强的电子产业集群。此外，嘉善经济技术开发区也吸引了大量上海工厂，主要集中在木业家居产业。

除了昆山和嘉善，苏州、无锡等地也是上海工厂迁移的重要目的地。这些地区不仅交通便利，而且生活配套设施成熟，为搬迁企业提供了一个良好的发展环境。

综上所述，上海工厂的迁移方向主要是长三角地区，特别是江苏省的苏州、昆山等地，这些地区因其地理位置、交通条件和优惠政策成为上海工厂迁移的首选地。